"Command & Conquer" to strategia czasu rzeczywistego, której fabuła gry opiera się na konflikcie pomiędzy Global Defence Initiative (GDI) - organizacji międzynarodowej powołanej przez ONZ oraz Bractwa Nod - potężnej siatki terrorystycznej, dowodzonej przez Kane'a (znanego również z cyklu "Red Alert").
Na ziemi odkryty zostaje nieznany dotąd, wyjątkowo toksyczny surowiec, o nazwie tyberium. Obie organizacje usiłują przejąć nad nim kontrolę, co wywołuje konflikt zbrojny- GDI stara się ograniczać skażenie i wykorzystać minerał w celach pokojowych, Nod z kolei zamierza użyć tyberium do ustanowienia nowego, ogólnoświatowego ładu.